內蒙古生物有機肥通過三種途徑減輕作物病害：

一是肥料中的功能性微生物生長繁殖，在作物根際土壤微生態(tài)系統(tǒng)內形成優(yōu)勢種群，抑制其它有害微生物的生長繁殖，甚至對部分有害病原菌產生拮抗作用，減少了有害微生物的危害機會。

二是功能性微生物在生長繁殖過程中向作物根際土壤微生態(tài)系統(tǒng)內分泌各種代謝產物，這些代謝產物能夠刺激作物生長，提高作物抵抗不良環(huán)境的能力。

三是生物有機肥營養(yǎng)元素全面，作物植株生長健壯，具有良好的株型和合理的群體，增強作物的抗病性，減少病害的發(fā)生。如白菜試驗，施用生物有機肥軟腐病發(fā)病率為2%，而蔬菜專用肥和干燥雞糞分別為17%和20%。